仿真模拟系统与实际操作相比，存在着一些本质性的差异。首先，虽然仿真模拟系统可以模拟真实环境和情况，但是仍然无法完全复制实际操作中的复杂性和多样性。实际操作中可能会受到许多意想不到的因素影响，而这些因素在仿真模拟系统中很难完全考虑到。因此，仿真模拟系统很难完全模拟出实际操作中的所有情况。
其次，仿真模拟系统往往建立在一定的假设和简化的模型基础之上，这就导致了模拟结果与真实情况之间的差异。实际操作中的复杂性往往超出了模型的设定范围，导致模拟结果与实际结果之间存在一定偏差。此外，在建立仿真模拟系统的过程中，可能会忽略一些细微的因素或变量，这些因素或变量在实际操作中可能会对结果产生重大影响。
另外，虽然仿真模拟系统可以进行大量的实验和测试，但是在某些特定情况下，实际操作仍然更为可靠和有效。有些问题可能只有在实际操作中才会暴露出来，而在仿真模拟系统中很难被发现。此外，有些操作可能涉及到人的行为和决策，这些因素在仿真模拟系统中很难完全模拟。
此外，仿真模拟系统通常需要大量的数据和计算资源来支撑模拟过程，而在实际操作中，数据的获取和处理可能会更为困难和复杂。此外，在一些特定行业或领域，仿真模拟系统可能无法完全模拟出真实操作中的专业知识和技能，这也是一个很大的局限性。
最后，仿真模拟系统往往是静态的，只能模拟特定时刻的情况，而实际操作是一个动态的过程，涉及到时间的推移和事件的发展。因此，仿真模拟系统可能无法完全反映实际操作中的动态变化和演化过程，这也是一个很大的差异点。